Fabuła serialu opowiada o historii trzech szkół magicznych: Alfea - szkoła dla wróżek i czarodziejek, Chmurna Wieża - szkoła dla czarownic, a także Czerwona Fontanna - szkoła dla chłopaków. Na początku poznajemy Bloom oraz jej cztery przyjaciółki z "Klubu Winx". Bloom dowiaduje się o istnieniu magicznego wymiaru Magix oraz o szkole dla czarodziejek, do której postanawia się udać. Wszystkie razem uczęszczają na zajęcia i uczą się magii, szybko się zaprzyjaźniają i zakładają Klub Winx. Głównymi przeciwniczkami Winx są trzy wiedźmy z Chmurnej Wieży - Trix (Icy, Darcy, Stormy). Początkowo chcą one odebrać Stelli pierścień Solari, ponieważ uważają, że jest w nim zaklęty Smoczy Płomień - największa we wszechświecie moc. Z czasem okazuje się, że tak naprawdę strażniczką smoczego płomienia jest Bloom. Niestety jednak dziewczyna nie potrafi go w sobie obudzić, pomaga jej w tym nimfa Daphne, która wkrótce potem okazuje się być siostrą Bloom. Czarodziejka dowiaduje się również, że była adoptowana i postanawia odnaleźć swoich prawdziwych rodziców. W konsekwencji Winx zwyciężają ze zbuntowanymi wiedźmami Trix.